Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms