Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mrpl3Q99N95 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms