Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pramel1Q99MW3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms