Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms