Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms