Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RtcbQ99LF4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RtcbQ99LF4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms