Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ctu1Q99J10 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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