Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sh3bgrl3Q91VW3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms