Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PxnQ8VI36 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PxnQ8VI36 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms