Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Klhdc3Q8VEM9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Klhdc3Q8VEM9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Klhdc3Q8VEM9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms