Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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