Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q8VDP2 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q8VDP2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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