Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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