Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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