Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms