Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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