Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssuh2Q8C3L1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssuh2Q8C3L1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssuh2Q8C3L1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssuh2Q8C3L1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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