Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg16l1Q8C0J2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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