Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trim35Q8C006 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trim35Q8C006 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms