Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms