Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl16Q8BSU2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms