Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms