Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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