Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms