Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Med16Q6PGF3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med16Q6PGF3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms