Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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