Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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NipblQ6KCD5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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NipblQ6KCD5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
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NipblQ6KCD5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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NipblQ6KCD5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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NipblQ6KCD5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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