Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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