Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms