Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms