Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Sbno1Q689Z5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
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Sbno1Q689Z5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sbno1Q689Z5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sbno1Q689Z5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sbno1Q689Z5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sbno1Q689Z5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms