Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.1 ms