Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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