Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sycp1Q62209 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sycp1Q62209 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sycp1Q62209 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sycp1Q62209 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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