Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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