Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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