Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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BcanQ61361 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BcanQ61361 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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