Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms