Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms