Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb6Q60692 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb6Q60692 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms