Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf123Q5XPI3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf123Q5XPI3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf123Q5XPI3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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