Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mdc1Q5PSV9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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