Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms