Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms