Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc4Q3UP44 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms