Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm648Q3UJ22 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm648Q3UJ22 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm648Q3UJ22 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm648Q3UJ22 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm648Q3UJ22 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm648Q3UJ22 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm648Q3UJ22 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm648Q3UJ22 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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