Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms