Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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