Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms