Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms